Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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