Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ifi47Q61635 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ifi47Q61635 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi47Q61635 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ifi47Q61635 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ifi47Q61635 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ifi47Q61635 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ifi47Q61635 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ifi47Q61635 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ifi47Q61635 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ifi47Q61635 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ifi47Q61635 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi47Q61635 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms