Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itm2aQ61500 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itm2aQ61500 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms