Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1aQ61495 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1aQ61495 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1aQ61495 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1aQ61495 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1aQ61495 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1aQ61495 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1aQ61495 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1aQ61495 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1aQ61495 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1aQ61495 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1aQ61495 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1aQ61495 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1aQ61495 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1aQ61495 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1aQ61495 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1aQ61495 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1aQ61495 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1aQ61495 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms