Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cd53Q61451 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd53Q61451 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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