Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms