Protein–RNA interactions for Protein: Q60865

Caprin1, Caprin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin1Q60865 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms