Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Traf3Q60803 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms