Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdkn2cQ60772 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms