Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atf3Q60765 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms