Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SkiQ60698 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SkiQ60698 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SkiQ60698 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SkiQ60698 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SkiQ60698 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SkiQ60698 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SkiQ60698 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms