Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms