Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms