Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Specc1Q5SXY1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms