Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Sco1Q5SUC9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Sco1Q5SUC9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Sco1Q5SUC9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Sco1Q5SUC9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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Sco1Q5SUC9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sco1Q5SUC9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms