Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Utp18Q5SSI6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms