Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc85aQ5SP85 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms