Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trdv2-2Q5R1A4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv2-2Q5R1A4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms