Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scarf1Q5ND28 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarf1Q5ND28 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms