Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms