Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SynaQ5G5D5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms