Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms