Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl5Q5DTT4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl5Q5DTT4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms