Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufaf2Q59J78 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufaf2Q59J78 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms