Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms