Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Slc27a5Q4LDG0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Slc27a5Q4LDG0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Slc27a5Q4LDG0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Slc27a5Q4LDG0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Slc27a5Q4LDG0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Slc27a5Q4LDG0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Slc27a5Q4LDG0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Slc27a5Q4LDG0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Slc27a5Q4LDG0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Slc27a5Q4LDG0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Slc27a5Q4LDG0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a5Q4LDG0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms