Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Defa20Q45VN2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Defa20Q45VN2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Defa20Q45VN2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Defa20Q45VN2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Defa20Q45VN2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Defa20Q45VN2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Defa20Q45VN2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Defa20Q45VN2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Defa20Q45VN2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa20Q45VN2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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