Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc110Q3V125 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms