Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc185Q3V118 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms