Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm6Q3UZD5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm6Q3UZD5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms