Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms