Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca4bQ3UW98 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms