Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clpsl2Q3UW21 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms