Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga4Q3UW12 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms