Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slfn4Q3UV66 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms