Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rmi2Q3UPE3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms