Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms