Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrxosQ3UL53 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms