Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lmod2Q3UHZ5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms