Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms