Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc58Q3UGP9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms