Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Brf2Q3UAW9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brf2Q3UAW9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms