Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip13Q3UA06 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms