Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U6N9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U6N9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U6N9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U6N9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U6N9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U6N9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U6N9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U6N9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U6N9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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