Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4S0

Pank2, Pantothenate kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pank2Q3U4S0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pank2Q3U4S0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pank2Q3U4S0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pank2Q3U4S0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms