Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms