Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms