Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms