Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTJ4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms