Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdpd4Q3TT99 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms